Bitki patojeni bakterilerin klasik, biyokimyasal, patojenite ve moleküler testler ile tanılandığı, bakteri-konukçu interaksiyonların incelendiği, bakteriyel hastalık etmenleri ile alternatif mücadele yöntemleri üzerine çalışmaların yapıldığı; ayrıca, kültür bitkilerinde ekonomik kayıplara sebep olan yabancı otların teşhis edildiği ve herbaryum örneklerinin yapldığı laboratuvardır. Laboatuvarda otoklav, etüv, pH metre, orbital çalkalayıcı, santrifüj, manyetik karıştırıcı, su banyosu, steril kabin, inkübatör, pcr cihazı, buzdolabı, hassas terazi, mikrodalga, spektrofotometre ve mikroskop bulunmaktadır.